(تنبيه مهم: قواعد البيانات خصوصًا "خزانة المخطوطات" قيد التعديل والتجريب، وهي لا تشمل حاليًا جميع رصيد المعهد، حيث سيتاح خلال الفترة القادمة أكثر تحديثًا حتى يصل بعدها إلى النسخة النهائية)

يتيح المعهد للمترددين عليه ولزائري موقعه الإلكتروني خدمة الاطلاع على رصيده من المخطوطات، وتقديم فهرسة وافية لمصورات مخطوطاته، لتسهيل طلبات الاطلاع والتصوير.

وهذه القاعدة هي ثمرة تطوير لقاعدة بيانات داخلية بالمعهد أنشئت سنة 1998، ثم قاعدة بيانات على الموقع الإلكتروني التجريبي سنة 2008.

وقد تم اختيار قاعدة بيانات ببليوجرافية عالمية مفتوحة المصدر هي كوها (Koha)، وتم تطويرها وتطويعها لمتطلبات المخطوط العربي وخصائصه، مع الالتزام بمعايير الفهرسة العالمية (مارك 21)، مع إمكانات متطورة للإدخال والاسترجاع والعرض.